对于朱载坖的想法，马森肯定是支持的，户部作为司掌国计的部门，但是却长期无法掌握大明的全部财政收入，这确实是个问题，朱载坖决心以此次九边的空饷为由，统一大明的财政，让户部真正履行作为计部，司掌国用的职能，同时理清九边的粮饷供应，将权责落实到人。
不过对于九边本色过少的问题，朱载坖除了改革盐政，增加开中之外，还没有想到什么好办法。
而高拱则建议清理军屯，在陕西三边和辽东等处恢复军屯，用以供应边镇的士卒，大明在开国初年确实实施过军屯，效果不错，但是现在各处的军屯早就废弛了，军官们往往占种膏腴，私役军士，虚报子粒，同时之前大明和蒙古的紧张关系也严重破坏了军屯。
之前俺答屡屡入侵，朝廷为了抵御蒙古人的南下，增强边境防御力量，不得不抽调大量屯军乃至余丁充实一线，这样其原来制定的四六、三七、二八的屯守之制便无法实行，造成屯田缺乏劳力，大量的军屯土地抛荒，而且陕西三边的土地本就贫瘠，产出甚少，稍微好一些的土地，都被各级军官们所瓜分了。
大明和蒙古频繁的冲突和战争使九边地区缺乏和平环境，根本无法从事正常的耕作，春不及种，秋不能收，边外之田大量抛荒，这又造成无田可屯的局面。无人无田，屯政兴举自然无从谈起。
马森等人认为，现在是大明和蒙古难得的和平时期，要抓紧时间整理军屯，如果边镇能够产出一些粮食，那么可以极大减轻朝廷转运本色的压力。
朱载坖随即想到玉米如今已经在北方推广种植了，陕西三边和山西也应该大规模推广种植，玉米确实是个好东西，玉米虽然是杂粮，但是毕竟能够管饱，也可以作为战马的精料给战马食用，同时玉米的秸秆粉碎之后添加豆粕也可以用于饲养战马。
要是日后玉米种植面积扩大了的话，还可以专门将玉米青贮，作为战马的饲料，但是军屯朱载坖认为实在是不太现实，不若大规模在陕西三边推广春玉米的种植，以减免赋税作为条件，由朝廷提供种子，就在陕西、甘肃、宁夏、山西还有辽东等处推广种植。
用于增加本地的粮食产量，当然军屯也不能放弃，在有能力的情况下也要恢复部分军屯，提高军储。
而九边本色的主要来源就是两个，开中和民运，开中只能暂且放在一边，民运是否能够有所增加，按照朝廷制度，北直隶、山西、山东、河南、陕西五省向九边输纳税粮，如山西输往大同、雁门、偏头、宣府、榆林等镇，陕西则供固原、甘肃、延绥、宁夏诸镇。
但是现在民运粮的折色情况也很严重，从嘉靖起，照依旧例，夏税每石征银9钱，秋粮每石征银1两征收已经是常态了，而民运的折色就导致九边的军储更加匮乏。
所以无论是朱载坖还是朝廷的重臣们都认为要恢复民运本色，来提高军储。
但是李春芳、葛守礼对于恢复民运本色持怀疑态度，原因很简单，民运有两个特点，一是民户所提供的米麦等军饷物资是其当年赋税的一部分；二是民户还得自己负责将物资运送到边仓。也就是说，对于百姓来说，缴纳民运本色，不仅仅是朝廷的田赋，更是一种沉重的徭役。