就在这剑拔弩张、一触即发之际，突然宫外传来一阵震耳欲聋的喊杀声。原来是杨逍带领明教众人攻城了。明教众人各个身手不凡，他们施展着明教的绝学，如猛虎下山般勇猛无畏。杨逍施展着“弹指神通”，指力如电，每一次出手，都能将敌人击退数丈之远。这“弹指神通”乃是桃花岛黄药师所创高深武功，需要深厚的内力作为支撑，杨逍修炼多年，早已将其练得炉火纯青。其他明教高手有的施展“圣火令武功”，招式诡异多变，让人防不胜防；有的施展“乾坤大挪移”，牵引着敌人的内力，将其化为己用。
马皇后和权臣脸色瞬间变得惨白，他们没想到明教众人竟如此大胆，竟敢公然攻城。张无忌趁机发动攻击，施展出乾坤大挪移。这乾坤大挪移共有七层境界，每一层都蕴含着无穷的奥秘。张无忌运转真气，只见他双手快速舞动，身形如鬼魅般飘忽，将黑衣人纷纷击退。为首的黑衣人只感觉自己的内力仿佛被一股无形的力量牵引，不受控制地朝着张无忌涌去，心中惊恐万分。
二殿下也站起身来，抽出佩剑。他自幼习武，剑法精湛，此刻他将心中的悲愤化作力量，每一剑都凌厉无比，剑风呼啸，与张无忌一同对抗敌人。在激烈的战斗中，张无忌和二殿下逐渐占据上风。马皇后和权臣见势不妙，想要逃跑。他们心中明白，一旦被抓住，必将面临万劫不复的下场。
张无忌岂会放过他们，他施展梯云纵，这梯云纵是武当派的轻功绝技，身如飞燕，瞬息之间便能掠出数丈之远。张无忌脚尖轻点，如苍鹰扑兔般瞬间追上两人，双手如铁钳一般，将他们一举擒获。马皇后和权臣被擒住的那一刻，脸上的得意和嚣张瞬间消失，取而代之的是恐惧和绝望。
此时，朱元璋看着眼前的一切，心中五味杂陈，终于忍不住老泪纵横。他想起自己病重期间，被马皇后和权臣蒙蔽，差点错怪了自己的儿子，心中满是悔恨。他虚弱地说道：“皇儿，是父皇错怪你了……”那声音中充满了愧疚和懊悔。二殿下连忙上前，握住朱元璋的手，泣不成声。父子俩的手紧紧握在一起，仿佛在这一刻，所有的误会和矛盾都烟消云散。
最终，朱元璋答应处理韩马两党一干人等，并让燕王退兵。燕王望着病榻上的父亲，心中虽有诸多不甘，但终究不忍拂逆朱元璋之意，长叹一声，决定退兵。这场惊心动魄的皇城危机，终于落下了帷幕，但江湖与朝堂的尖锐矛盾，终究还是一触即发。