“师兄！”致远紧紧地握着孙元化那满是伤痕的手，眼眶泛红，声音带着一丝哽咽，“我绝对不会让你就这样死去的！你的价值无可估量，大明需要像你这样忠勇之士啊！”
孙元化惨然一笑，他那张原本俊朗的脸庞此刻已是血肉模糊，令人不忍直视。“致远啊……我如今这副模样又能做得了什么呢？为了大明，我可谓是呕心沥血，倾尽所有。然而到头来，竟落得如此凄惨的下场……我对大明之心，天地可表、日月可鉴呐！当年努尔哈赤之死，其中亦有我的一份功劳，我怎会背叛大明？就算是打死我，我也绝不会承认这莫须有的罪名！我虽然已经无法再上马提刀奋勇杀敌，但我的骨气依然坚硬如铁，脊梁始终挺直不屈！那些凶残的敌人尚且未能将我击垮，可如今竟是自己人要置我于死地……罢了罢了，尽管来吧！我孙元化绝不会向他们低头弯腰！”
说到此处，孙元化那布满血丝的双眼望向远方，仿佛透过这冰冷阴暗的牢房看到了曾经金戈铁马、保家卫国的岁月。
“师兄……”致远咬着嘴唇，强忍着泪水说道，“师父他老人家也一直在为你四处奔走，想尽办法营救你。”
闻听此言，一直坚强不屈的孙元化再也忍不住了，泪水如决堤的洪水般汹涌而出。他想起了师父平日里对自己的悉心教导和关爱呵护，心中充满了愧疚与自责：“都是我不好，是我连累了师父……”
“师兄，切莫要如此自责啊！这并非你的过错，相信终有一天，历史会还你清白，证明一切的。请放心吧，师兄，无论如何，我都会想尽一切办法救你出来的。”张好古紧紧地握着师兄的手，眼中满是坚定与决绝。
说完这番话后，张好古心情沉重、步伐踉跄地缓缓走出了那阴森恐怖的诏狱。他心中暗暗发誓，哪怕需要付出所有的代价，甚至不惜倾家荡产，也一定要将师兄从这必死之局中解救出来。然而，命运似乎总是喜欢捉弄人，就在张好古尚未回到家中之时，一个噩耗如晴天霹雳般传来——朝廷已经正式下达了文书：孙元化被认定为此次祸乱的首犯，判决秋后处斩；而张涛则被定为次罪，同样难逃秋后问斩的厄运。至于其他涉案人员，诸如余大成、王徵、宋光兰等人，则被判处遣戍充军之刑。
又过了一天，首辅周延儒得知此事后，心生怜悯，想要劝说徐光启出面为孙元化求情开脱。当周延儒亲自登门拜访并向徐光启说明来意时，徐光启却只是轻轻地摇了摇头，长叹一声道：“唉……我的大弟子怕是难以保住性命了。不过好在我还有另一个弟子，我必须要保留这副有用之躯，为他遮风挡雨、保驾护航啊。若非这个小弟子，恐怕我早就辞官归隐，安享晚年了。”
面对徐光启的这番回答，周延儒深感无奈，但他并未就此放弃。为了拯救孙元化的生命，周延儒毅然决然地选择以辞去首辅一职作为最后的抗争手段，希望能够用自己的官位换取孙元化的一条生路。可惜事与愿违，尽管朝廷准许了周延儒的辞职请求，但对于他提出的放人条件却是断然拒绝，而且皇帝还发了话，如果谁在给孙元化求情，等同死罪。